Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Lockd-201ENSMUST00000183867 5662 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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OtofQ9ESF1 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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OtofQ9ESF1 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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OtofQ9ESF1 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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OtofQ9ESF1 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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OtofQ9ESF1 Zc3h12c-201ENSMUST00000165519 6133 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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OtofQ9ESF1 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm37233-201ENSMUST00000192173 6263 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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OtofQ9ESF1 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Sec24c-201ENSMUST00000048657 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
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OtofQ9ESF1 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
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OtofQ9ESF1 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
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OtofQ9ESF1 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
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OtofQ9ESF1 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Polr3a-201ENSMUST00000026322 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gpr35-201ENSMUST00000027489 3270 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Nkrf-201ENSMUST00000057093 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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