Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 659.5 ms