Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Tas1r3-201ENSMUST00000030949 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Pcdh11x-201ENSMUST00000050239 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gli3-201ENSMUST00000110510 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm37150-201ENSMUST00000193900 2754 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Pigr-201ENSMUST00000027675 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Tubgcp5-201ENSMUST00000032627 3905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Satb1-203ENSMUST00000129667 2896 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gbp7-202ENSMUST00000171263 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Clec1a-201ENSMUST00000037481 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Trim2-202ENSMUST00000065380 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Pes1-202ENSMUST00000109985 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Pes1-201ENSMUST00000020705 2911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm43411-201ENSMUST00000196235 1579 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gk-202ENSMUST00000113978 4279 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm28469-201ENSMUST00000186374 2166 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm28134-201ENSMUST00000188690 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm37075-201ENSMUST00000191888 2166 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm37574-201ENSMUST00000194264 2166 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 4833420G17Rik-203ENSMUST00000224312 3406 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 4930447C04Rik-208ENSMUST00000136075 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm3138-201ENSMUST00000165431 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Ttc41-203ENSMUST00000217747 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
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