Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Ambra1-201ENSMUST00000045699 4690 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Sycp1-201ENSMUST00000029448 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Olfr522-201ENSMUST00000050585 4766 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm43890-201ENSMUST00000203437 2799 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gabrq-202ENSMUST00000114553 4943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Zfyve16-201ENSMUST00000022217 6150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm45903-201ENSMUST00000212891 2898 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms