Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Tnfrsf23-202ENSMUST00000152703 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 4930453H23Rik-201ENSMUST00000125569 1719 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 B230118H07Rik-203ENSMUST00000111231 2273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Supt20-203ENSMUST00000197502 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Tbc1d15-201ENSMUST00000020339 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 4921517D22Rik-201ENSMUST00000061597 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Ppp1r9a-204ENSMUST00000168998 2966 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Vmn1r176-202ENSMUST00000226319 2930 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 AW209491-201ENSMUST00000038690 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm17130-201ENSMUST00000201542 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 9230112J17Rik-201ENSMUST00000216749 2333 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Zfp964-201ENSMUST00000169125 1416 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm14692-201ENSMUST00000114672 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm1140-201ENSMUST00000114675 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 1700123O12Rik-202ENSMUST00000141312 660 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Fbxl12-210ENSMUST00000155301 476 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm28980-201ENSMUST00000187877 219 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm42767-201ENSMUST00000198583 632 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm17995-201ENSMUST00000209266 530 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Olfr209-204ENSMUST00000213779 564 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Ehhadh-201ENSMUST00000023559 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Phc3-203ENSMUST00000099163 2808 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Prepl-201ENSMUST00000072406 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm36993-201ENSMUST00000192983 2980 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm36938-201ENSMUST00000191612 2696 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Nprl2-201ENSMUST00000010201 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm4919-201ENSMUST00000117825 604 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm24050-201ENSMUST00000158623 290 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc29Q80VM3 Gm23027-201ENSMUST00000158771 158 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms