Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 B930095G15Rik-201ENSMUST00000130256 4715 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Nod2-202ENSMUST00000109634 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 F10-202ENSMUST00000063820 2503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Fgfbp1-202ENSMUST00000199481 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Fam161b-201ENSMUST00000021659 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Hipk2-207ENSMUST00000162359 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Tgs1-201ENSMUST00000052712 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 AC158622.2-201ENSMUST00000217363 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 AC123842.1-201ENSMUST00000217622 3118 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm36993-201ENSMUST00000192983 2980 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Crispld1-201ENSMUST00000095075 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Eif2ak4-205ENSMUST00000110872 4907 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 BC016579-201ENSMUST00000036732 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Chid1-203ENSMUST00000118694 3910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Ptprc-207ENSMUST00000183301 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Zfp286-201ENSMUST00000054654 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Fmo5-202ENSMUST00000107049 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Myo18a-209ENSMUST00000108376 7374 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Olfr314-202ENSMUST00000205189 2647 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Lrrc29-204ENSMUST00000210801 3830 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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