Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Sv2c-201ENSMUST00000161263 9101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 A730049H05Rik-201ENSMUST00000057977 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Ctnnd1-224ENSMUST00000111698 5850 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Hsf2bp-201ENSMUST00000002145 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Gstm7-203ENSMUST00000106688 783 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 4930483O08Rik-201ENSMUST00000209850 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PcolceQ61398 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Cep170-215ENSMUST00000195717 6967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 AC165260.6-205ENSMUST00000224190 9762 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Golga3-201ENSMUST00000031477 4805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PcolceQ61398 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms