Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Rpl21-ps5-201ENSMUST00000095940 483 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Srp54a-201ENSMUST00000021407 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 3110099E03Rik-203ENSMUST00000143695 1353 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Olfr467-202ENSMUST00000208563 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Olfr467-203ENSMUST00000214253 1855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Trp53cor1-201ENSMUST00000133221 2956 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Tex21-201ENSMUST00000021453 2137 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Spink10-201ENSMUST00000055725 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Dennd6a-205ENSMUST00000224378 2424 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Trpv1-202ENSMUST00000102526 3361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Olfr743-202ENSMUST00000215793 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Anapc15-210ENSMUST00000144207 3103 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 B3gnt2-201ENSMUST00000055549 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 4921509C19Rik-201ENSMUST00000080132 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Ppargc1a-205ENSMUST00000196968 2754 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Phc3-210ENSMUST00000177992 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm45194-202ENSMUST00000207962 1991 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm28821-201ENSMUST00000185637 610 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
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