Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm6536-201ENSMUST00000171180 615 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Lpp-201ENSMUST00000038053 15647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Acad11-201ENSMUST00000047799 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Pla2g2a-203ENSMUST00000135748 788 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm44950-201ENSMUST00000206403 2296 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 AC158596.1-201ENSMUST00000217315 2265 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Casp8-202ENSMUST00000165549 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Olfr97-206ENSMUST00000216225 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 CT571245.1-201ENSMUST00000218642 3465 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms