Protein–RNA interactions for Protein: Q148W8

Dusp27, Inactive dual specificity phosphatase 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp27Q148W8 Olfr544-201ENSMUST00000051201 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 4930448K20Rik-202ENSMUST00000182072 1433 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Vmn1r180-201ENSMUST00000173816 5060 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Mtf1-201ENSMUST00000030723 7631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm17034-201ENSMUST00000168990 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Atr-201ENSMUST00000034980 8056 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm29028-201ENSMUST00000186297 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm37066-201ENSMUST00000192713 2061 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Kif5a-202ENSMUST00000217895 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Dclk1-201ENSMUST00000054237 7847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Fnbp1-207ENSMUST00000113559 4378 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Srcap-206ENSMUST00000186954 9345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Myof-201ENSMUST00000041475 6902 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Ep400-204ENSMUST00000112436 10685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 5330416C01Rik-203ENSMUST00000144993 3287 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Ikbkg-207ENSMUST00000114133 6994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm9378-201ENSMUST00000120315 471 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Vmn2r-ps81-201ENSMUST00000172519 838 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Unc79-208ENSMUST00000179002 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Pkib-202ENSMUST00000075992 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Pde1c-205ENSMUST00000166102 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Gm35392-201ENSMUST00000209934 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dusp27Q148W8 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms