Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Mtif2-201ENSMUST00000020749 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 AW146154-201ENSMUST00000098509 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm37022-201ENSMUST00000192517 2254 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Olfr936-201ENSMUST00000178303 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Ets1-205ENSMUST00000184364 678 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Klk1b2-ps-201ENSMUST00000206099 786 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 AC160635.1-201ENSMUST00000216731 474 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Olfr935-201ENSMUST00000080748 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 A730085K08Rik-201ENSMUST00000177015 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 CT009515.4-201ENSMUST00000228165 1494 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Olfr1312-202ENSMUST00000213582 2891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gm28884-201ENSMUST00000190367 3994 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PrcdQ00LT2 Mir763-201ENSMUST00000103249 120 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms