Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm44148-201ENSMUST00000203718 316 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Prb3-ps-201ENSMUST00000204675 1111 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC139579.1-201ENSMUST00000214560 606 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm18292-201ENSMUST00000216673 919 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm9280-201ENSMUST00000223155 517 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Rab25-201ENSMUST00000008745 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC154482.1-201ENSMUST00000223248 2483 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Grip1-207ENSMUST00000130387 2780 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Atg4a-201ENSMUST00000112971 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Dnaic1-201ENSMUST00000102963 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Sox6-203ENSMUST00000166207 2825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Btbd16-201ENSMUST00000048453 3434 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 CT571245.1-201ENSMUST00000218642 3465 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gja1-206ENSMUST00000220069 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Rasgrp1-205ENSMUST00000173541 2283 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Mill2-205ENSMUST00000227379 1998 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gsdma2-202ENSMUST00000093938 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr169-202ENSMUST00000215040 2316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Zbtb26-202ENSMUST00000102789 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Trp53cor1-201ENSMUST00000133221 2956 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Msr1-201ENSMUST00000026021 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Dnajb5-202ENSMUST00000084662 3302 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm2136-201ENSMUST00000193945 2577 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Faf2-203ENSMUST00000126071 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm10286-201ENSMUST00000093603 5077 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Atxn7l1-210ENSMUST00000144586 3042 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Kbtbd4-202ENSMUST00000111464 2343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm43800-201ENSMUST00000201868 2731 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Trav9n-4-201ENSMUST00000103626 595 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Zfp637-204ENSMUST00000112861 1202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Mir467f-201ENSMUST00000116923 120 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Pinlyp-201ENSMUST00000011776 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm16150-201ENSMUST00000127620 437 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Cul1-203ENSMUST00000143941 530 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr721-ps1-201ENSMUST00000165291 975 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm6871-204ENSMUST00000171059 462 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Mir5625-201ENSMUST00000176598 80 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm20914-201ENSMUST00000180372 684 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm27353-201ENSMUST00000184712 122 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm29561-201ENSMUST00000187838 631 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 1700124L16Rik-203ENSMUST00000190077 1110 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm9729-201ENSMUST00000196364 265 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm43129-201ENSMUST00000201237 603 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm26911-203ENSMUST00000204781 369 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm44588-201ENSMUST00000208401 545 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm45338-205ENSMUST00000210795 728 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC154687.1-201ENSMUST00000224875 677 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 1700010B08Rik-201ENSMUST00000073081 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm4825-201ENSMUST00000079690 408 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Snora57-201ENSMUST00000093658 148 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Selenop-201ENSMUST00000082424 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm15834-201ENSMUST00000129740 2097 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 4930533K18Rik-203ENSMUST00000219192 1307 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Hibch-202ENSMUST00000159352 1704 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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