Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm17137-201ENSMUST00000164106 4371 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Igsf1-203ENSMUST00000114891 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Gm24071-201ENSMUST00000104520 132 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Mrps18c-202ENSMUST00000112898 460 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Gm7393-201ENSMUST00000172650 739 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Rbx1-ps-201ENSMUST00000173786 327 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Gm8167-201ENSMUST00000183320 958 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Gm27187-202ENSMUST00000184873 606 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 5430433H01Rik-201ENSMUST00000193978 542 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Spink10-201ENSMUST00000055725 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Olfr120-201ENSMUST00000077498 993 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Olfr650-ps1-201ENSMUST00000121432 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 EU599041-203ENSMUST00000205748 1492 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Gfral-201ENSMUST00000074880 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Gm34184-201ENSMUST00000216477 2713 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Zfp113-202ENSMUST00000132318 488 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Gm371-201ENSMUST00000142240 1245 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Olfr270-202ENSMUST00000172257 939 ntAPPRIS P2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Olfr936-201ENSMUST00000178303 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Gm28264-201ENSMUST00000190657 398 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Gm29250-201ENSMUST00000191372 368 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Gm45388-202ENSMUST00000211101 815 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Gm33103-201ENSMUST00000212717 527 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Asb12-201ENSMUST00000033549 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Olfr888-201ENSMUST00000075228 945 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Olfr935-201ENSMUST00000080748 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Gm16391-201ENSMUST00000086601 447 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P20040 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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