Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr628-201ENSMUST00000098193 1553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm23835-201ENSMUST00000104439 132 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Efcab9-202ENSMUST00000109377 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm10651-201ENSMUST00000118212 609 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm13458-201ENSMUST00000118239 367 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm25845-201ENSMUST00000122588 310 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm16159-201ENSMUST00000126122 947 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm1322-201ENSMUST00000134620 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Kbtbd8os-201ENSMUST00000135145 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm13269-201ENSMUST00000143458 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Rubie-201ENSMUST00000151828 1137 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Aste1-204ENSMUST00000167674 1227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm3239-202ENSMUST00000169675 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm20396-201ENSMUST00000173358 745 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm21886-201ENSMUST00000178391 645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 4930535O05Rik-201ENSMUST00000184406 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 2610001J05Rik-204ENSMUST00000185361 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 1700029J03Rik-202ENSMUST00000189879 712 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm42823-201ENSMUST00000197975 256 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Plut-203ENSMUST00000201192 569 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm44285-201ENSMUST00000203557 940 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm18402-201ENSMUST00000203834 586 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr214-202ENSMUST00000203867 1255 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr1357-203ENSMUST00000205085 1012 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm5586-201ENSMUST00000206264 795 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Kcne3-207ENSMUST00000208260 929 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm4270-201ENSMUST00000209666 406 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC127254.1-201ENSMUST00000216563 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC160635.1-201ENSMUST00000216731 474 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm19810-201ENSMUST00000218521 251 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC131100.1-201ENSMUST00000226328 470 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Tmcc1-209ENSMUST00000173548 1622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Ppp1r9a-204ENSMUST00000168998 2966 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gria3-209ENSMUST00000165288 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Wac-202ENSMUST00000092112 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Acsl1-203ENSMUST00000110372 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Sept14-201ENSMUST00000042266 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Supt20-203ENSMUST00000197502 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Stx8-203ENSMUST00000108675 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm28670-201ENSMUST00000185365 1498 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm29537-202ENSMUST00000186153 1498 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm29497-201ENSMUST00000186801 1498 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm28568-201ENSMUST00000187762 1498 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm29445-202ENSMUST00000189947 1497 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm28458-202ENSMUST00000190542 1497 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm28457-202ENSMUST00000191277 1498 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm37654-201ENSMUST00000193019 1498 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Slitrk2-201ENSMUST00000036043 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm44141-201ENSMUST00000204231 1583 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Oog4-201ENSMUST00000061277 1981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Sema3d-205ENSMUST00000197927 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Vmn1r37-206ENSMUST00000228791 1617 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107 ms