Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

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Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Olfr270-202ENSMUST00000172257 939 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm24696-201ENSMUST00000083878 134 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Kantr-207ENSMUST00000195280 4212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gria1-202ENSMUST00000094179 5399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm10600-201ENSMUST00000117202 2047 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm5120-201ENSMUST00000215231 2414 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Uggt1-201ENSMUST00000046875 9033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Neurod1-201ENSMUST00000041099 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Zfp407-202ENSMUST00000125763 7906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Olfr433-202ENSMUST00000214690 2968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Lyrm1-205ENSMUST00000207270 5845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 F10-202ENSMUST00000063820 2503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm15704-201ENSMUST00000144757 2818 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Lsamp-202ENSMUST00000099761 8794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Thrb-201ENSMUST00000022303 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Pcdh15-225ENSMUST00000149977 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Pex5l-208ENSMUST00000192093 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Eif2ak4-204ENSMUST00000110870 5116 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Arhgap17-204ENSMUST00000205262 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Cd36-201ENSMUST00000082367 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Patj-206ENSMUST00000107033 3624 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 AC123069.1-201ENSMUST00000215094 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Foxp3-202ENSMUST00000115738 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Lpin1-202ENSMUST00000111067 5433 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Tmem106b-201ENSMUST00000031556 6002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 C7-201ENSMUST00000110689 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Acpp-202ENSMUST00000112590 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 D3Ertd254e-202ENSMUST00000197653 6689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 AC160562.1-201ENSMUST00000216170 3468 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Prkd3-202ENSMUST00000118768 2847 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 U2af1l4-205ENSMUST00000163482 668 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm26264-201ENSMUST00000083278 159 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Synpo2-201ENSMUST00000051443 3719 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Prdm15-201ENSMUST00000095849 6346 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Cdh3-201ENSMUST00000080797 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Mcf2l-208ENSMUST00000110879 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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