Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Lpp-201ENSMUST00000038053 15647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Ssr3-201ENSMUST00000029414 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm13921-201ENSMUST00000119411 463 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm11955-201ENSMUST00000119801 470 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Vmn1r-ps103-201ENSMUST00000120171 893 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm13586-201ENSMUST00000121784 464 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm11838-201ENSMUST00000121999 231 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Rpl29-203ENSMUST00000150576 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Ttc9c-204ENSMUST00000153281 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm20500-201ENSMUST00000174621 321 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm20627-202ENSMUST00000176275 564 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm28264-201ENSMUST00000190657 398 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm29250-201ENSMUST00000191372 368 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm43840-201ENSMUST00000199444 484 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Mypopos-204ENSMUST00000206381 473 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm8575-201ENSMUST00000210262 521 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Spaca7-203ENSMUST00000210276 715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm35035-201ENSMUST00000218838 628 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 AC163041.2-201ENSMUST00000223082 573 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 1700024P04Rik-201ENSMUST00000054425 481 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Nrxn3-210ENSMUST00000167887 3303 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Fcgr3-201ENSMUST00000164044 1347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Cyp24a1-201ENSMUST00000038824 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm14032-201ENSMUST00000117686 1026 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm13526-201ENSMUST00000117970 189 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm12993-201ENSMUST00000119900 479 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Rpl9-ps2-201ENSMUST00000120821 577 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm25266-201ENSMUST00000158521 304 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 1700071M16Rik-202ENSMUST00000167672 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Tdgf1-ps1-201ENSMUST00000179882 516 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms