Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Chil5-203ENSMUST00000200146 1296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 3830406C13Rik-201ENSMUST00000112669 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Anapc15-210ENSMUST00000144207 3103 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Ankfn1-203ENSMUST00000169201 2232 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Vmn2r41-201ENSMUST00000168807 3617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gstm7-203ENSMUST00000106688 783 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Elavl2-206ENSMUST00000107116 1282 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm17233-201ENSMUST00000168470 698 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm31881-202ENSMUST00000199455 559 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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