Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms