Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms