Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17190V9GX38 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm17190V9GX38 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms