Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd1Q9Z2E2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd1Q9Z2E2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd1Q9Z2E2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd1Q9Z2E2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd1Q9Z2E2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd1Q9Z2E2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd1Q9Z2E2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd1Q9Z2E2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd1Q9Z2E2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd1Q9Z2E2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd1Q9Z2E2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd1Q9Z2E2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd1Q9Z2E2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd1Q9Z2E2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd1Q9Z2E2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd1Q9Z2E2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mbd1Q9Z2E2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mbd1Q9Z2E2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mbd1Q9Z2E2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mbd1Q9Z2E2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mbd1Q9Z2E2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms