Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Pdpk1Q9Z2A0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Pdpk1Q9Z2A0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Pdpk1Q9Z2A0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Pdpk1Q9Z2A0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Pdpk1Q9Z2A0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Pdpk1Q9Z2A0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Pdpk1Q9Z2A0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdpk1Q9Z2A0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdpk1Q9Z2A0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdpk1Q9Z2A0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdpk1Q9Z2A0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdpk1Q9Z2A0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdpk1Q9Z2A0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdpk1Q9Z2A0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdpk1Q9Z2A0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdpk1Q9Z2A0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdpk1Q9Z2A0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdpk1Q9Z2A0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdpk1Q9Z2A0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdpk1Q9Z2A0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdpk1Q9Z2A0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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