Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms