Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms