Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms