Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms