Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N7

Arid3b, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3bQ9Z1N7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arid3bQ9Z1N7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arid3bQ9Z1N7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arid3bQ9Z1N7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arid3bQ9Z1N7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arid3bQ9Z1N7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arid3bQ9Z1N7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arid3bQ9Z1N7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms