Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms