Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms