Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms