Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms