Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms