Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms