Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Slit3Q9WVB4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms