Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV71

Asb4, Ankyrin repeat and SOCS box protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asb4Q9WV71 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Asb4Q9WV71 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Asb4Q9WV71 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Asb4Q9WV71 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asb4Q9WV71 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Asb4Q9WV71 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms