Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkraQ9WTX2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms