Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms