Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sorbs3Q9R1Z8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sorbs3Q9R1Z8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sorbs3Q9R1Z8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sorbs3Q9R1Z8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sorbs3Q9R1Z8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sorbs3Q9R1Z8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sorbs3Q9R1Z8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sorbs3Q9R1Z8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sorbs3Q9R1Z8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sorbs3Q9R1Z8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sorbs3Q9R1Z8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sorbs3Q9R1Z8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sorbs3Q9R1Z8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sorbs3Q9R1Z8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms