Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms