Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Y8

Gabrg1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg1Q9R0Y8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrg1Q9R0Y8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabrg1Q9R0Y8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms