Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NrkQ9R0G8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NrkQ9R0G8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NrkQ9R0G8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NrkQ9R0G8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NrkQ9R0G8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NrkQ9R0G8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NrkQ9R0G8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NrkQ9R0G8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NrkQ9R0G8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NrkQ9R0G8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NrkQ9R0G8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NrkQ9R0G8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NrkQ9R0G8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NrkQ9R0G8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NrkQ9R0G8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NrkQ9R0G8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NrkQ9R0G8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NrkQ9R0G8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NrkQ9R0G8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NrkQ9R0G8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
NrkQ9R0G8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NrkQ9R0G8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
NrkQ9R0G8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NrkQ9R0G8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NrkQ9R0G8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NrkQ9R0G8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NrkQ9R0G8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NrkQ9R0G8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NrkQ9R0G8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NrkQ9R0G8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NrkQ9R0G8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NrkQ9R0G8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NrkQ9R0G8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NrkQ9R0G8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NrkQ9R0G8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NrkQ9R0G8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NrkQ9R0G8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NrkQ9R0G8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NrkQ9R0G8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NrkQ9R0G8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NrkQ9R0G8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NrkQ9R0G8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms