Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms