Protein–RNA interactions for Protein: Q9R060

Nubp1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp1Q9R060 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms