Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms