Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms