Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp21Q9QZL6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms