Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Rdh11Q9QYF1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Rdh11Q9QYF1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Rdh11Q9QYF1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Rdh11Q9QYF1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Rdh11Q9QYF1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Rdh11Q9QYF1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Rdh11Q9QYF1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Rdh11Q9QYF1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Rdh11Q9QYF1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Rdh11Q9QYF1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Rdh11Q9QYF1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Rdh11Q9QYF1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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