Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY6

Ehd3, EH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ehd3Q9QXY6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ehd3Q9QXY6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ehd3Q9QXY6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms