Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms