Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Kcnip3Q9QXT8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Kcnip3Q9QXT8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Kcnip3Q9QXT8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Kcnip3Q9QXT8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Kcnip3Q9QXT8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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